La Central de Servicios de Exportación, está organizada funcionalmente por una coordinación del IBRAF, por un gerente ejecutivo apoyado por una Asesoría Técnica Científica y aconsejada por un Consejo de Consultivo. La ejecución y acciones para atender las necesidades de la fruticultura brasileña es realizada por centros de excelencia, de acuerdo a su vocación y competencia.